Molecular mechanism of luteolin in treatment of cervical cancer based on network pharmacology and molecular docking technology
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摘要:目的
基于网络药理学与分子对接技术探讨木犀草素治疗宫颈癌的分子机制。
方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对木犀草素进行类药性分析。分别在PharmMapper、Super-PRED和Swiss Target Prediction数据库中获取木犀草素作用靶点。运用GeneCards、OMIM和PharmGKB数据库获取宫颈癌相关靶点。通过EVenn获得木犀草素与宫颈癌的交集靶点, 并使用Cytoscape3.8.1构建“木犀草素-交集靶点-宫颈癌”网络图。利用STRIING数据库对交集靶点进行蛋白质互作(PPI)网络分析，筛选核心靶点。采用David数据库对靶点进行基因本体论(GO)基因功能分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。利用PyMoL 2.6.0、AutoDockTool 1.5.7和OpenBabel 2.4.1软件开展核心靶点与木犀草素的分子对接。将核心靶点在GEPIA数据库中进行生存分析及泛癌分析。
结果获得木犀草素靶点449个、宫颈癌相关靶点1 334个; 木犀草素与宫颈癌交集靶点100个，其中核心靶点有24个，包括MMP2、HRAS、MAPK1、AKT1、RHOA和PGR等。GO和KEGG富集分析发现交集靶点参与生物过程455条，细胞组分70条，分子功能119条和143条KEGG信号通路。分子对接发现MMP2与木犀草素结合较好。宫颈癌患者生存曲线显示RHOA、MAPK1、MMP2和AKT1基因风险比率>1, HRAS和PGR的风险比率 < 1。泛癌分析显示HRAS和MAPK1在宫颈癌中高表达，并且HRAS有显著表达差异。
结论木犀草素通过多靶点、多途径的作用方式治疗宫颈癌。
Abstract:ObjectiveTo explore the molecular mechanism of luteolin in the treatment of cervical cancer based on network pharmacology and molecular docking technology.
MethodsThe drug-like properties of luteolin were analyzed by the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). The targets of luteolin were obtained from PharmMapper, Super-PRED, and Swiss Target Prediction databases. The targets related to cervical cancer were acquired from GeneCards, OMIM, and PharmGKB databases. The intersection targets of luteolin and cervical cancer were obtained through EVenn, and the "luteolin-intersection targets-cervical cancer" network diagram was constructed by Cytoscape 3.8.1. The STRING database was used to analyze the protein-protein interaction (PPI) network of intersection targets and screen the core targets. The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (David) was used to conduct Gene Ontology (GO) gene function analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) signaling pathway enrichment analysis of the targets. PyMoL 2.6.0, AutoDockTool 1.5.7 and OpenBabel 2.4.1 software were used to perform molecular docking between the core targets and luteolin. The survival analysis and pan-cancer analysis of the core targets were performed in the GEPIA database.
ResultsA total of 449 targets of luteolin and 1 334 targets related to cervical cancer were obtained; there were 100 intersection targets between luteolin and cervical cancer, of which 24 were core targets, including MMP2, HRAS, MAPK1, AKT1, RHOA and PGR. GO and KEGG enrichment analyses revealed that the intersection targets participated in 455 biological processes, 70 cellular components, 119 molecular functions, and 143 KEGG signaling pathways. Molecular docking revealed a good binding of MMP2 with luteolin. The survival curves of cervical cancer patients showed that the risk ratios of RHOA, MAPK1, MMP2 and AKT1 genes were greater than 1, while those of HRAS and PGR were less than 1. Pan-cancer analysis showed that HRAS and MAPK1 were highly expressed in cervical cancer, and HRAS had significant expression differences.
ConclusionLuteolin treats cervical cancer through a multi-target and multi-pathway mechanism.
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Keywords:
- network pharmacology /
- cervical cancer /
- luteolin /
- molecular mechanism /
- molecular docking /
- signaling pathway
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脑卒中是导致中国人群死亡的重要原因，其中缺血性脑卒中约占卒中总数的70%[1]。缺血性脑卒中是一种复杂的、受遗传等多因素影响的疾病，不但发病率和病死率高，而且复发和残疾的风险也很高[2]。研究[3-4]表明载脂蛋白E(ApoE)基因多态性等遗传因素参与缺血性脑卒中的发生、治疗和预后，ApoE基因多态性可能通过调节血脂水平影响动脉粥样硬化和缺血性脑卒中的发生。与高加索地区人群相比，携带ε4等位基因的亚洲人群发生缺血性脑卒中的风险更高[5]。在中国人群中，研究[6-8]也证实ApoEε4等位基因携带者罹患缺血性脑卒中的风险更大。此外, ApoE基因多态性不仅与缺血性脑卒中密切相关，而且与其危险因素如高血压、糖尿病[10]、冠状动脉粥样硬化[11]及高胆固醇血症[12]等疾病也密切相关，较之ε2和ε3等位基因，ε4等位基因携带者发生上述疾病的风险明显增高。
ApoE由人类19号染色体上的ApoE基因编码，是一种主要在肝脏合成的多态性蛋白[13], 在脂质运输和代谢过程中发挥重要作用，参与多种疾病的发生和预后。ApoE基因有2个常见、非同义多态性位点526C>T和388T>C, 二者形成3种等位基因[ε2(388T-526T)、ε3(388T-526C)、ε4(388C-526C)]及6种基因表型[14](ε2/ε2、ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4、ε4/ε4)。目前有关ApoE基因多态性的研究多集中在与阿尔兹海默病[15]、脑卒中[6]、糖尿病[6]等疾病相关性方面，目前有关河北地区ApoE基因多态性与缺血性脑卒中及其危险因素的相关研究较少。本研究采用聚合酶链式反应(PCR)-荧光探针法对河北地区缺血性脑卒中患者进行ApoE基因多态性检测，并检测卒中人群脂蛋白a[Lp(a)]、尿酸(UA)及血脂水平等，分析缺血性脑卒中患者ApoE基因多态性分布及其与缺血性脑卒中危险因素(如糖尿病、高血压、高尿酸血症、高血脂等)的相关性，现将结果报告如下。
1. 资料与方法
1.1 一般资料
选取2019年10—12月河北医科大学第一医院神经内科门诊就诊的1 027例缺血性脑卒中患者为研究对象。缺血性脑卒中纳入标准: ①年龄≥40岁者; ②缺血性脑卒中诊断参考《中国急性缺血性脑卒中诊治指南2018》[6]，脑CT或MRI检查确认脑内有缺血性病变者。排除标准: ①近1个月内(通过确认患者的病历)服用降脂药物者; ②合并严重感染、肿瘤、严重的肝肾功能障碍和其他影响血脂的疾病者; ③合并阿尔茨海默病、冠状动脉粥样硬化性心脏病等疾病者。
为进一步分析ApoE基因多态性与缺血性脑卒中危险因素的相关性，筛选门诊中住院的资料齐全的患者716例，将其分为3组，即ε2等位基因携带者(ε2/ε2、ε2/ε3)、ε3等位基因携带者(ε3/ε3)、ε4等位基因携带者(ε3/ε4、ε4/ε4)。排除ε2/ε4基因型(因其对血脂代谢的相反作用)。本研究经河北医科大学第一医院伦理委员会审批(批准号20190418), 患者及其家属对研究项目知情并签署知情同意书。
1.2 仪器和试剂
PCR扩增仪及DNA提取仪: 全自动核酸提纯及荧光PCR分析仪Anadus9850(厦门安普利生物工程有限公司); 人类SLCO1B1和ApoE基因多态性检测试剂盒(PCR-荧光探针法)(武汉友芝友医疗科技有限公司，批号19052008); 血液基因组DNA提取试剂盒(厦门安普利生物工程有限公司)。
1.3 方法
1.3.1 血液基因组DNA提取
抽取受试者空腹静脉血2 mL置于EDTA抗凝管中，使用核酸提取试剂盒(厦门安普利生物工程有限公司)提取血液中的基因组DNA，严格按试剂盒说明书进行提取和检测。
1.3.2 PCR反应体系和扩增条件
在2 μL待测样本的基因组DNA(推荐浓度为5~15 ng/μL)、弱阳性对照和空白对照反应管中分别加入装有23 μL SLCO1B1*lb、SLCO1B1*5、ApoE2、ApoE4的反应液，再进行PCR扩增检测。PCR反应条件: 尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG)处理阶段为37 ℃下10 min, 循环1次; 预变性阶段为95 ℃下5 min, 循环1次; PCR阶段为95℃下15 s、60 ℃下45 s, 循环40次(设置在此阶段结束时采集荧光信号)。
1.3.3 血液学指标检测
于清晨抽取患者空腹静脉血2 mL进行血液学指标检测，采用Beckman LX20全自动血生化分析仪检测UA、Lp(a)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平。高胆固醇血症标准为TC≥5.72 mmol/L, HDL≤0.90 mmol/L, LDL-C≥3.64 mmol/L[17]。
1.4 统计学分析
采用SPSS 22.0软件进行统计学分析, Hardy-Weinberg平衡采用χ2检验或Fisher精确检验; 采用方差分析或Wilcoxon秩和检验评估尿酸、Lp(a)、血脂等与ApoE基因多态性的关系; 通过单因素和多因素Logistic回归分析计算95%置信区间(CI)和优势比(OR)。P < 0.05为差异有统计学意义。
2. 结果
2.1 河北地区缺血性脑卒中患者ApoE基因型和等位基因分布特点
河北地区缺血性脑卒中患者ApoE基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P=0.87、0.27)。在汉族人群的6种ApoE基因型中, ε3/ε3型占69.52%, 其余由高至低依次为ε2/ε3型(15.00%)、ε3/ε4型(12.46%)、ε2/ε4型(2.14%)、ε4/ε4型(0.49%)和ε2/ε2型(0.39%), ApoE基因型和等位基因在男性和女性患者中的分布差异无统计学意义(P=0.395、0.641)。见表 1。
表 1 缺血性脑卒中患者等位基因和基因型频率分布[n(%)]等位基因/基因型 男性(n=582) 女性(n=445) 总病例(n=1 027) ε2/ε2 2(0.34) 2(0.45) 4(0.39) ε2/ε3 85(14.60) 69(15.51) 154(15.00) ε2/ε4 13(2.23) 9(2.02) 22(2.14) ε3/ε3 410(70.45) 304(68.31) 714(69.52) ε3/ε4 69(11.86) 59(13.26) 128(12.46) ε4/ε4 3(0.52) 2(0.45) 5(0.49) ε2 * 102(8.76) 82(9.21) 184(8.96) ε3 * 974(83.68) 736(82.70) 1710(83.25) ε4 * 88(7.56) 72(8.09) 160(7.79) *表示计算ε2、ε3、ε4比率时，基因型总数为2 054(1 027×2), 其中男性基因型总数为1 164, 女性基因型总数为890。 2.2 缺血性脑卒中患者的临床特征及其与危险因素的相关性
ε2等位基因携带组、ε3等位基因携带组、ε4等位基因携带组的高血压、糖尿病发生率及UA、同型半胱氨酸(Hcy)水平无差异，但3组Lp(a)、TG、LDL-C及高胆固醇血症发生率比较，差异有统计学意义(P=0.003、0.042、0.019、0.013), 表现为ε2等位基因携带者TG水平高于ε4等位基因携带者，而ε4等位基因携带者Lp(a)、LDL-C水平及高胆固醇血症发生率高于ε2等位基因携带者。见表 2、图 1。ε4等位基因携带组TC水平有升高趋势, HDL-C水平有降低趋势，但差异无统计学意义(P>0.05); ε2等位基因携带组与ε3等位基因携带组TG、TC、LDL-C、HDL-C水平差异无统计学意义(P>0.05)。
表 2 ε2、ε3和ε4等位基因携带组患者临床资料的比较[n(%)][M(P25, P75)]临床资料 ε2等位基因携带组(n=104) ε3等位基因携带组(n=515) ε4等位基因携带组(n=97) P 年龄/岁 60(52, 68) 62(54, 68) 63(52, 69) 0.633 BMI/(kg/m 2) 25.27(22.89, 27.31) 25.06(23.44, 27.34) 25.24(23.44, 27.23) 0.866 男性 59(56.73) 296(57.48) 54(55.67) 0.944 高血压 61(58.65) 318(61.75) 56(57.73) 0.678 糖尿病 21(20.19) 112(21.75) 22(22.68) 0.908 饮酒史 23(22.12) 134(26.02) 27(27.84) 0.619 吸烟史 24(23.08) 141(27.38) 54(55.67) 0.652 UA/(mmol/L) 312.4(258.00, 397.60) 319.90(271.45, 366.60) 319.10(253.00, 379.00) 0.380 Lp(a)/(mmol/L) 94.10(63, 45, 226.00) 154.00(85.70, 323.30) 164(96.30, 286.70) 0.003 * Hcy/(mmol/L) 14.94(11.03, 20.94) 13.90(11.22, 20.38) 14.38(11.78, 18.97) 0.965 TG/(mmol/L) 1.49(1.12, 1.95) 1.30(0.96, 1.81) 1.37(0.95, 1.89) 0.042 * TC/(mmol/L) 4.43(4.00, 5.18) 4.69(3.94, 5.45) 4.80(3.97, 5.71) 0.128 HDL-C/(mmol/L) 1.10(0.89, 1.27) 1.05(0.91, 1.25) 0.99(0.88, 1.19) 0.129 LDL-C/(mmol/L) 2.87(2.37, 3.31) 3.01(2.43, 3.55) 3.17(2.58, 3.84) 0.019 * 高胆固醇血症 47(45.19) 230(44.66) 59(60.82) 0.013 * BMI: 体质量指数; UA: 尿酸; Lp(a): 脂蛋白a; Hcy: 同型半胱氨酸; TG: 甘油三酯; TC: 总胆固醇;
HDL-C: 高密度脂蛋白胆固醇; LDL-C: 低密度脂蛋白胆固醇。
*表示ε2或ε3等位基因携带组与ε4等位基因携带组比较, 差异有统计学意义。![]()
图 1 ε2、ε3和ε4等位基因携带组患者临床指标水平比较A: 3组TG水平比较; B: 3组TC水平比较; C: 3组HDL-C水平比较; D: 3组LDL-C水平比较; E: 3组UA水平比较; F: 3组Hcy水平比较; G: 3组Lp(a)水平比较。*表示组间差异有统计学意义, ns表示组间差异无统计学意义。2.3 ApoE基因多态性与高胆固醇血症的相关性
为进一步探讨ApoE基因多态性与高胆固醇血症的关系，以高胆固醇血症为因变量, ApoE基因型及临床指标为自变量，进行单因素Logistic回归分析，各项变量赋值见表 3。结果显示, ApoE ε4等位基因(OR=1.924, 95%CI为1.235~2.997, P=0.004)、糖尿病(OR=1.963, 95%CI为1.367~2.820, P < 0.001)是高胆固醇血症发生的危险因素，见表 4。
表 3 高胆固醇相关危险因素的变量赋值表变量 赋值 0 1 2 性别 男 女 — 高血压 无 有 — 糖尿病 无 有 — 吸烟史 无 有 — 饮酒史 无 有 — ApoE基因型 (ε2/ε2+ε2/ε3) (ε3/ε3) (ε3/ε4+ε4/ε4) 表 4 高胆固醇血症相关危险因素的单因素Logistic回归分析变量 OR 95%CI P 年龄 0.776 0.576~1.044 0.094 性别 0.829 0.615~0.117 0.218 体质量指数 1.039 0.997~1.083 0.069 高血压 1.095 0.811~1.480 0.553 糖尿病 1.963 1.367~2.820 <0.001 饮酒史 1.081 0.773~1.512 0.694 吸烟史 0.913 0.654~1.274 0.592 ApoE基因型 1.924 1.235~2.997 0.004 在校正单因素回归分析中P < 0.10的因素后，将年龄、ε4等位基因、糖尿病、体质量指数(BMI)纳入多因素回归方程中，使用前进法分析，结果发现以ε3/ε3基因型为参照, ApoEε4等位基因与高胆固醇血症的风险增加相关(OR=1.943, 95%CI为1.240~3.043)。见表 5。回归分析的Hosmer-Lymeshaw检验显示, χ2=12.171、P=0.144, 表明该模型与原始数据吻合良好。
表 5 高胆固醇血症危险因素的多因素逐步法Logistic回归分析变量 OR(95%CI) P 年龄 0.993(0.978~1.007) 0.324 体质量指数 1.035(0.992~1.079) 0.110 糖尿病 2.001(1.384~2.893) < 0.001 ApoE ε3(ε3/ε3) 1.000 — ε2(ε2/ε2+ε2/ε3) 1.032(0.672~1.585) 0.885 ε4(ε3/ε4+ε4/ε4) 1.943(1.240~3.043) 0.004 多因素回归分析以ε3/ε3基因型为参照。 3. 讨论
ApoE基因多态性的分布在不同种族间存在差异。本研究中，缺血性脑卒中患者中ε3/ε3基因型比率最高(69.52%), 而ε2/ε2基因型比率最低(0.39%), 与河北地区[18]、华中地区[19]和南部地区[20]数据相似。在等位基因分布数据方面，河北地区缺血性脑卒中患者ε2等位基因频率(8.96%)略低于健康(9.4%)或无缺血性脑卒中(6.51%~19.40%)[2, 7, 21]的中国人群, ε4等位基因频率(7.79%)亦低于既往研究[2, 3, 7, 22]报告的数据。本研究还发现, ApoE等位基因频率与既往研究[23]报道的白种人等位基因频率差异较大，后者ε4、ε2、ε3的等位基因频率分别为15%、8%和77%。这提示不同种族和地区间ApoE基因多态性分布存在明显的差异。作者分析本研究与既往中国人群报道存在差异的原因为: 本研究对纳入患者进行了详细的筛选，排除了合并有严重认知功能障碍、冠心病等与ε4等位基因比率升高密切相关的疾病，更准确地反映了ε4等位基因在缺血性脑卒中人群中的分布特征。
ApoE基因多态性与缺血性脑卒中相关，但ApoE是对缺血性脑卒中有直接影响，还是通过影响其危险因素进而间接影响疾病的发生，目前尚无定论。本研究针对缺血性脑卒中人群，分析了ApoE与其危险因素(如高血压、糖尿病、高UA、高Hcy、高胆固醇血症等)的相关性，结果并未发现ApoE基因多态性与高血压、糖尿病等疾病的发生率具有相关性。本研究发现ε4等位基因携带者高胆固醇血症的发病率及Lp(a)、LDL-C水平显著增高，考虑到ApoE基因多态性可显著影响脂质代谢，而脂质异常代谢又会造成胆固醇水平升高，不仅使患者罹患缺血性脑卒中的风险升高，也增加了高血压、动脉粥样硬化、糖尿病等相关危险因素的发生风险，从而进一步影响脑卒中的发生。
本研究进行了单因素和多因素回归分析，发现在调整年龄、BMI、糖尿病和ApoE基因型后, ε4等位基因增加了患者罹患高胆固醇血症的风险; 与ε3/ε3基因型相比, ε4等位基因使缺血性脑卒中患者发生高胆固醇血症的风险增加了1.943倍(OR=1.943, 95%CI为1.240~3.043), 这也与既往研究[12, 24]相似。上述结果提示，无论是通过影响高血压、冠状动脉粥样硬化、高胆固醇血症等危险因素，还是对其产生直接影响, ApoE基因多态性对缺血性脑卒中的影响都与血脂代谢紊乱这一环节紧密相连, ApoE基因多态性作为脂质代谢的重要影响因素，对缺血性脑卒中的发生产生一定的影响。
因此，对于携带ε4等位基因的缺血性脑卒中患者，应鼓励其控制胆固醇摄入量，坚持少食多餐的原则，倡导良好的生活方式，戒烟和限酒，并进行适当的活动。此外，本研究也发现ε2等位基因携带者TG水平偏高，建议患者在满足日常基本营养需求的基础上，控制总能量的摄入，合理搭配各营养元素的组成比例，控制体质量，戒烟限酒，并坚持定期中强度代谢运动[25], 从而维持体内血脂水平的稳定，预防高胆固醇血症及缺血性脑卒中等疾病的发生。
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图 2 木犀草素-宫颈癌靶点
A: 木犀草及木犀草素; B: 宫颈癌示意图; C: 蓝色、黄色和绿色分别代表在PharmMapper、Super-PRED和Swiss Target Prediction数据库获得的药物靶点; D: 蓝色、黄色和绿色分别代表GeneCards、OMIM和PharmGKB数据库获得的宫颈癌靶点。
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图 3 木犀草素-宫颈癌靶点可视化
A: 木犀草素与宫颈癌交集靶点图，紫色代表木犀草素，蓝色代表宫颈癌; B: 成分-靶点-疾病图，红色菱形代表木犀草素，粉色正方形代表宫颈癌，深绿、浅绿和黄色代表木犀草素和宫颈癌的交集靶点。
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图 5 木犀草素治疗宫颈癌的GO富集分析
A、B、C: 木犀草素治疗宫颈癌的49个交集靶点前20条涉及的生物过程、细胞组分和分子功能，气泡大小表示富集靶点的数量，气泡颜色的深浅代表P值大小。
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图 8 木犀草素与其抗宫颈癌核心靶点存在直接相互作用
A: 木犀草素与其抗宫颈癌核心靶点分子对接评分热图; B: 木犀草素与核心靶点的分子对接3D可视化图，黄色虚线表示氢键，小分子表示木犀草素，木犀草素通过氢键相连的部分为互作氨基酸。
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图 9 宫颈癌患者生存分析
A: MMP2在宫颈癌患者中的生存曲线; B: HRAS在宫颈癌患者中的生存曲线; C: MAPK1在宫颈癌患者中的生存曲线; D: AKT1在宫颈癌患者中的生存曲线; E: RHOA在宫颈癌患者中的生存曲线; F: PGR在宫颈癌患者中的生存曲线。
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[1] SUNG H, FERLAY J, SIEGEL R L, et al. Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries[J]. CA Cancer J Clin, 2021, 71(3): 209-249. doi: 10.3322/caac.21660
[2] SINGH D, VIGNAT J, LORENZONI V, et al. Global estimates of incidence and mortality of cervical cancer in 2020: a baseline analysis of the WHO Global Cervical Cancer Elimination Initiative[J]. Lancet Glob Health, 2023, 11(2): e197-e206.
[3] REVATHIDEVI S, MURUGAN A K, NAKAOKA H, et al. APOBEC: a molecular driver in cervical cancer pathogenesis[J]. Cancer Lett, 2021, 496: 104-116.
[4] RAHANGDALE L, MUNGO C, O'CONNOR S, et al. Human papillomavirus vaccination and cervical cancer risk[J]. BMJ, 2022, 379: e070115.
[5] GOPU P, ANTONY F, CYRIAC S, et al. Updates on systemic therapy for cervical cancer[J]. Indian J Med Res, 2021, 154(2): 293-302.
[6] 程志新, 公瑞, 张玥, 等. 基于数据挖掘的臁疮古医案内治法用药规律研究[J]. 实用临床医药杂志, 2023, 27(10): 25-30. doi: 10.7619/jcmp.20230525 [7] FRANZA L, CARUSI V, NUCERA E, et al. Luteolin, inflammation and cancer: Special emphasis on gut microbiota[J]. Biofactors, 2021, 47(2): 181-189.
[8] NABAVI S F, BRAIDY N, GORTZI O, et al. Luteolin as an anti-inflammatory and neuroprotective agent: a brief review[J]. Brain Res Bull, 2015, 119(Pt A): 1-11.
[9] RAKOCZY K, KACZOR J, SOŁTYK A, et al. Application of luteolin in neoplasms and nonneoplastic diseases[J]. Int J Mol Sci, 2023, 24(21): 15995.
[10] CHEN Y H, WU J X, YANG S F, et al. Synergistic combination of luteolin and Asiatic acid on cervical cancer in vitro and in vivo[J]. Cancers, 2023, 15(2): 548.
[11] DING L L, CHEN H, BI G L, et al. Improved anti-cancer effects of luteolin@ZIF-8 in cervical and prostate cancer cell lines[J]. Heliyon, 2024, 10(6): e28232.
[12] LI X, WEI S Z, NIU S Q, et al. Network pharmacology prediction and molecular docking-based strategy to explore the potential mechanism of Huanglian Jiedu Decoction against sepsis[J]. Comput Biol Med, 2022, 144: 105389.
[13] LIU X F, OUYANG S S, YU B, et al. PharmMapper server: a web server for potential drug target identification using pharmacophore mapping approach[J]. Nucleic Acids Res, 2010, 38(Web Server issue): W609-W614.
[14] GALLO K, GOEDE A, PREISSNER R, et al. SuperPred 3. 0: drug classification and target prediction-a machine learning approach[J]. Nucleic Acids Res, 2022, 50(W1): W726-W731.
[15] DAINA A, MICHIELIN O, ZOETE V. SwissTargetPrediction: updated data and new features for efficient prediction of protein targets of small molecules[J]. Nucleic Acids Res, 2019, 47(W1): W357-W364.
[16] DAINA A, ZOETE V. Application of the SwissDrugDesign online resources in virtual screening[J]. Int J Mol Sci, 2019, 20(18): 4612.
[17] STELZER G, ROSEN N, PLASCHKES I, et al. The GeneCards Suite: From Gene Data Mining to Disease Genome Sequence Analyses[J]. Curr Protoc Bioinformatics, 2016, 54: 30-33.
[18] AMBERGER J S, BOCCHINI C A, SCOTT A F, et al. OMIM. org: leveraging knowledge across phenotype-gene relationships[J]. Nucleic Acids Res, 2019, 47(D1): D1038-D1043.
[19] STEVENS T, SANGKUHL K, BROWN J T, et al. PharmGKB summary: methylphenidate pathway, pharmacokinetics/pharmacodynamics[J]. Pharmacogenet Genomics, 2019, 29(6): 136-154.
[20] DENNIS G, SHERMAN B T, HOSACK D A, et al. DAVID: database for annotation, visualization, and integrated discovery[J]. Genome Biol, 2003, 4(9): R60.
[21] MUEGGE I, HU Y. Recent advances in alchemical binding free energy calculations for drug discovery[J]. ACS Med Chem Lett, 2023, 14(3): 244-250.
[22] WANG X, WANG Z Y, ZHENG J H, et al. TCM network pharmacology: a new trend towards combining computational, experimental and clinical approaches[J]. Chin J Nat Med, 2021, 19(1): 1-11.
[23] NOGALES C, MAMDOUH Z M, LIST M, et al. Network pharmacology: curing causal mechanisms instead of treating symptoms[J]. Trends Pharmacol Sci, 2022, 43(2): 136-150. doi: 10.1016/j.tips.2021.11.004
[24] HAN X, WANG C, LI R, et al. Network target theory and network pharmacology: Next generation drug research in medicine using AI models[J]. Int J Clin Pharmacol Ther, 2024, 62(4): 151-154.
[25] 许继升, 宋爱莉, 王静, 等. 基于数据挖掘和网络药理学探讨宋爱莉教授治疗肉芽肿性小叶性乳腺炎的经验[J]. 实用临床医药杂志, 2023, 9(5): 49-54. doi: 10.7619/jcmp.20222860 [26] 金雪宁, 林飞, 冯心怡, 等. 基于网络药理学的多西他赛治疗绒毛膜癌的作用机制研究[J]. 实用临床医药杂志, 2022, 8(1): 18-21. doi: 10.7619/jcmp.20213494 [27] ZHANG Q, YANG M Y, QU Z, et al. Corrigendum to "Autophagy prevention sensitizes AKTi-1/2-induced anti-hepatocellular carcinoma cell activity in vitro and in vivo" [Biochem. Biophys. Res. Commun. (2016) 480(3) 334-340][J]. Biochem Biophys Res Commun, 2021, 565: 99.
[28] YANG Y F, HUANG L, ZHANG N, et al. SUMOylation of annexin A6 retards cell migration and tumor growth by suppressing RHOU/AKT1-involved EMT in hepatocellular carcinoma[J]. Cell Commun Signal, 2024, 22(1): 206.
[29] 金雪宁, 林飞, 冯心怡, 等. 基于网络药理学的多西他赛治疗绒毛膜癌的作用机制研究[J]. 实用临床医药杂志, 2022, 26(1): 18-21. doi: 10.7619/jcmp.20213494 [30] 罗字呈, 杨桃, 陈江, 等. 基于网络药理学及生物信息学探讨藤梨汤治疗结直肠癌的作用机制研究[J]. 空军军医大学学报, 2024(3): 311-318. [31] 曾炼, 杨桃, 陈江, 等. 基于网络药理学和分子对接探讨艾迪注射液治疗结直肠癌作用机制研究[J]. 空军军医大学学报, 2024, 45(03): 319-325. [32] 甘丽华, 李志敏, 何泉, 杨坤, 郭超峰. 基于分子对接技术与网络药理学分析方法的半夏-黄连药对治疗胃食管反流病的作用机制研究[J]. 实用临床医药杂志, 2021, 25(21): 1-6. doi: 10.7619/jcmp.20211655 [33] LI L, SHEN F R, CHENG Q X, et al. SLC5A3 is important for cervical cancer cell growth[J]. Int J Biol Sci, 2023, 19(9): 2787-2802.
[34] LI S, MA Y M, ZHENG P S, et al. GDF15 promotes the proliferation of cervical cancer cells by phosphorylating AKT1 and Erk1/2 through the receptor ErbB2[J]. J Exp Clin Cancer Res, 2018, 37(1): 80.
[35] LIU Z, LIU F, WANG F, et al. CircZNF609 promotes cell proliferation, migration, invasion, and glycolysis in nasopharyngeal carcinoma through regulating HRAS via miR-338-3p[J]. Mol Cell Biochem, 2021, 476(1): 175-186.
[36] PAN Y B, GU Y M, LIU T H, et al. Epitranscriptic regulation of HRAS by N6-methyladenosine drives tumor progression[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2023, 120(14): e2302291120.
[37] RIEKE D T, SCHR?DER S, SCHAFHAUSEN P, et al. Targeted treatment in a case series of AR+, HRAS/PIK3CA co-mutated salivary duct carcinoma[J]. Front Oncol, 2023, 13: 1107134.
[38] BAI H, SONG M, JIAO R, et al. DUSP7 inhibits cervical cancer progression by inactivating the RAS pathway[J]. J Cell Mol Med, 2021, 25(19): 9306-9318.
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期刊类型引用(1)
1. 田洪伦，罗洁，韩小娟，祝静，彭宁，任真奎. 阿尔茨海默病患者Hcy、FOL、Vit B_(12)水平与ApoE基因多态性研究. 中外医学研究. 2023(18): 162-166 . 
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